幻魔司政官は己の血を受け継いだ子をヒト類に生ませるという不可解な行動を続けていた。

幻魔を父に持つ双子ルーフとジンはヒト類にはない巨大な超能力を持っていた。

二人はお互いに兄弟がいることを知らぬまま様々な経験を重ね、運命が二人を引き合わせると、やがて倒すべき父親の幻魔に戦いを挑む。

月が地球に急接近する絶望的なシーンで物語の幕は閉じる。

幻魔に対抗しようと超能力者を結集するが、幻魔の強大な力にはとても及ばなかった。

高校生の東丈は超能力に目覚め、宇宙を無に帰せんとする幻魔と闘わねばならない現実を知る。

少年マガジン版『幻魔大戦』の小説化版である『幻魔大戦(小説決定版)』は角川書店の小説誌「野性時代」に連載され、角川文庫から刊行された（これが後に角川映画によるアニメ映画に繋がっていく）。

『真幻魔大戦』は、少年マガジン版『幻魔大戦』と『新幻魔大戦』を受ける形で成立していた。

少年マガジン版『幻魔大戦』の小説化版である『幻魔大戦(小説決定版)』は角川書店の小説誌「野性時代」に連載され、角川文庫から刊行された（これが後に角川映画によるアニメ映画に繋がっていく）。しかし本来、リメイク程度にとどめるはずだった小説化版『幻魔大戦（小説決定版）』は、漫画版における幻魔との超能力合戦から独自に発展した挙句、主人公・東丈が失踪したまま第1期が完結し、続編の第2期幻魔大戦「ハルマゲドン」に至り、完全に漫画版とは異なるパラレルワールドを形成しつつ収束せずに未完となる。

平井にとって本命となる作品は、完結編として人類の勝利を描く『真幻魔大戦』だった。